Саентологи активно используют методы психологических манипуляций и занимаются сбором негативной информации — правдивой и ложной — о людях, которые либо могут использоваться в интересах организации, либо воюют с «Церковью саентологии».
В России саентологи прославились достаточно большим количеством преступлений, прежде всего, в экономической сфере, когда они создают различные тренинговые компании, нелегальные школы, другие структуры, которые занимаются преступной деятельностью.
На сегодня имеется целый ряд уголовных дел, возбужденных в отношении различных саентологических структур и конкретных адептов, в том числе, по вопросам мошенничества в сфере жилищного строительства, а также связанных с незаконной предпринимательской деятельностью, незаконным сбором, хранением и распространением информации о частной личной жизни граждан. Количество таких уголовных дел на сегодня множится и они регулярно завершаются не в пользу саентологов.
Ряд книг, публикаций, работ основателя движения — Рона Хаббарда признан экстремистскими, их названия можно найти на сайте Минюста в перечне экстремистских материалов.